Loona mõisat on esmamainitud 1506. aastal. Keskaegse vasallilinnuse keldriruumidele püstitatud ühekorruseline kivist mõisahoone on ehitatud mitmes järgus peamiselt 17.-18. sajandil. Oma praeguseni säilinud saaremaalikult tagasihoidliku klassitsistlikku välimuse sai hoone 19. sajandi alguspoolel. Mõisakompleksi kuuluvad härrastemaja, tõllakuur, aidamaja, aiapaviljon (RMK Kivimaja) ja karjakastell (RMK infopunkt). Hoonestusele liitub meeleolukas pargiala, mida ilmestasid varasemalt pargipaviljonid ja dolomiidist dekoratiivdetailid: lõvikuju, kraatervaasid jne.
Käesoleval ajal asuvad Loona mõisas külalistemaja, restoran ja RMK Vilsandi Rahvuspargi külastuskeskus.